基于ITS2互补碱基变化分析的中药基原物种鉴定研究

项目名称： 基于ITS2互补碱基变化分析的中药基原物种鉴定研究

项目编号： No.81373922

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 医药、卫生

项目作者： 宋经元

作者单位： 中国医学科学院药用植物研究所

项目金额： 70万元

中文摘要： 分子标记ITS2序列二级结构的 "互补碱基变化（CBCs）"已成功用于生物物种的鉴定，而ITS2的 CBCs规律在中药基原物种鉴定中的特性未被解析。本项目利用课题组已经获得根、茎、叶、花、果等不同部位入药的中药基原物种43万条ITS2序列，借助ITS2序列数据库二级结构预测工具进行空间结构构建，分析同一物种内、不同物种间的CBCs分布规律，揭示CBCs存在可能是中药基原物种鉴定的关键因素。进一步以乌头属和卷柏属中药基原物种为研究对象，利用高通量测序技术和ITS2序列空间结构分析，阐明同一物种内、不同物种间的CBCs分布规律，验证在大量近缘物种存在时CBCs对中药基原物种鉴定的影响。本项目将为中药DNA条形码鉴定和中药基原物种形成的研究奠定重要理论基础，有助于推动中药分子鉴定的实践应用，促进中药鉴定学走在国际生物分类和鉴定研究的前沿。

中文关键词： 中药基原物种；DNA条形码；第二内部转录间隔区；二级结构；互补碱基变化

英文摘要： Compensatory base changes (CBCs) in the ribosomal RNA (rRNA) internal transcribed spacer 2 (ITS2) secondary structures have been used to successfully verify the taxonomy of closely related species. However, CBCs have never been used to distinguish origina

英文关键词： Original species in Chinese medicine；DNA barcoding；The second internal transcribed spacer (ITS2)；Secondary structure；Compensatory base changes (CBCs)