联合GWAS与RNA-Seq技术挖掘马头山羊捻转血矛线虫抗性的基因组区域与关键基因

项目名称： 联合GWAS与RNA-Seq技术挖掘马头山羊捻转血矛线虫抗性的基因组区域与关键基因

项目编号： No.31402040

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 农业科学

项目作者： 杜小勇

作者单位： 华中农业大学

项目金额： 26万元

中文摘要： 胃肠道寄生虫病严重影响山羊的生长发育与健康状态，给生产带来巨大的损失。本项目以捻转血矛线虫为模型，在前期研究基础上，运用全基因组关联分析（GWAS）与RNA-Seq的整合分析技术，系统挖掘马头山羊抗胃肠道寄生虫感染的关键基因组区域与基因。（1）在山羊基因组测序草图完成的基础上，用测序判定基因型技术（GBS）为基础的GWAS，在马头山羊和波尔山羊群体全基因组水平深度扫描与抗捻转血矛线虫病相关的基因组区域和重要SNP位点；（2）以抗寄生虫感染与非抗性的马头山羊小肠粘膜为样本，构建基于RNA-Seq技术的比较转录组，结合免疫基因数据库，构建与山羊胃肠道寄生虫抗性紧密关联的免疫基因网络；（3）联合GWAS与免疫基因网络数据，通过多重组学数据的整合，深入揭示中国地方山羊抵抗寄生虫感染的组学基础。本研究预期成果可为山羊寄生虫抗性的分子改良提供基础数据，有助于全面了解马头山羊的种质特性，故具有重要的意义

中文关键词： 山羊；捻转血矛线虫；全基因组关联分析；抗病性；基因鉴定

英文摘要： Gastrointestinal parasite have great influnece on the growth and the development of goat, that have brought serious loss to goat production. Based on the goat genome sequencing map and kown immune genetic information, our project is able to study host gen

英文关键词： goat；Haemonchus contortus；GWAS；genetic resistance；gene identification