增加高通量DNA测序阅读长度方法研究

项目名称： 增加高通量DNA测序阅读长度方法研究

项目编号： No.60971018

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 肖鹏峰

作者单位： 东南大学

项目金额： 30万元

中文摘要： 本项目依据具有自主知识产权的循环测序法原理，提出增加序列测定阅读长度的两个新策略，发展我国的高通量DNA 测序技术。在"延长测序引物重新定位测序起点法"中，将上一循环已经测定的一段序列作为新的测序引物的一部分，使新测序引物杂交到上次序列测定的碱基位置，重新定位测序起点开始下一轮回的序列测定；在"缩短测序模板重新定位测序起点法"中，通过限制性内切酶将已经测得DNA碱基序列的模板片段切割掉，再将模板重新连接一段测序引物杂交片段，重新定位测序起点开始下一轮回的序列测定。测序阅读长度的增加可以提高拼接组装效率、拼接序列的准确性，减少测定次数和拼接的计算量，大大降低高通量序列测定的成本。

中文关键词： 高通量DNA测序；循环测序；连接测序；合成测序；

英文摘要：

英文关键词： High-throughput DNA sequencing；Cyclic sequencing；Sequencing-by-ligation；Sequencing-by-synthesis；