microRNA靶基因识别的系统生物学

项目名称： microRNA靶基因识别的系统生物学

项目编号： No.31570843

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2015

项目学科： 生物科学

项目作者： 曾严

作者单位： 南京农业大学

项目金额： 25万元

中文摘要： microRNAs（miRNA）是一类抑制蛋白编码靶基因表达的小RNA。据预测, 每个miRNA有数百个靶基因，但目前我们并不知道预测基因多少是正确的及它们受miRNA调节的程度。为回答这些问题，我们将用人类细胞模型研究三个代表性miRNA的功能。为每个miRNA, 构建一个疑似靶基因的荧光素酶报告基因的文库。报告基因转染细胞时, miRNA对荧光素酶的影响将显示对应的基因是否确为靶基因和它受miRNA调控的程度。然后, 计算方法将研究miRNA调节基因的决定因素。最后，为表明内源基因使用相同的机制，我们将进行人细胞和组织基因组数据的荟萃分析。若内源靶基因的表达与受miRNA抑制的程度呈负相关，这将表明miRNA在体内基因的差异性表达中发挥了突出作用，从而揭示miRNA差异性抑制靶基因(此特性已被概括为相对特异性)的功能意义。

中文关键词： microRNA；microRNA靶基因；相对特异性；基因表达；

英文摘要： microRNAs (miRNAs) are a class of small RNAs that inhibit the expression of specific protein-encoding genes in eukaryotes. A miRNA is typically predicted by computational methods to have hundreds of such target genes, although it is unclear how many of t

英文关键词： microRNA；microRNA target gene；relative specificity；gene expression；