果蝇RNA沉默抗病毒作用机制及其微进化研究

项目名称： 果蝇RNA沉默抗病毒作用机制及其微进化研究

项目编号： No.91231110

项目类型： 重大研究计划

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 吴清发

作者单位： 中国科学技术大学

项目金额： 80万元

中文摘要： RNA沉默是果蝇抵抗外源病毒感染的主要机制，但果蝇针对单链和双链RNA病毒的免疫反应不同，其对应的分子机制仍不清楚。我们将以野生型果蝇和RNA沉默通路中相关基因的突变体为研究对象，分别接种这些基因型果蝇单链和双链RNA病毒后，研究它们的生存曲线和体内累积的病毒RNA量的相关性。我们将提取接种病毒后果蝇的总RNA，分别制备小RNA的cDNA文库和RNA-seq库，并进行深度测序。我们将通过对数据深度挖掘，来研究RNA沉默通路中各个基因抗病毒作用分子机制的差异，理解RNA沉默对单链和双链RNA病毒免疫作用差异的分子基础，建立RNA沉默抗病毒机制和其它抗病毒机制间的联系。我们还将研究果蝇的基因组变异，特别是引起抗病毒基因功能和表达水平改变的变异，和天然潜伏病毒之间互作的微进化关系。通过本课题的研究，将深入理解果蝇的RNA沉默抗病毒机制的分子基础、寄主和潜伏病毒互相适应的微进化关系等重要科学问题。

中文关键词： RNA 沉默；病毒；果蝇；微进化；深度测序

英文摘要： The fruit fly Drosophila melanogaster is a powerful model for studying innate immunity. Recent studies have demonstrated that protection of Drosophila against viruses with an RNA genome is mainly mediated by the RNA interference (RNAi) pathway. There is o

英文关键词： RNA silencing；virus；Drosophila；microevolution；deep sequencing