项目名称: 基于microRNA协同调控模块挖掘和验证肾透明细胞癌的联合诊断标记
项目编号: No.31400712
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 生物科学
项目作者: 陈佳佳
作者单位: 苏州科技学院
项目金额: 24万元
中文摘要: 癌症的早期诊断是复杂疾病诊疗中的难题,对其准确诊断必须考虑基因间的合作调控。microRNA是肿瘤诊断的潜在生物标记,目前多数研究局限于单分子层面,忽略了它们间的协同作用,临床诊断价值有限,microRNA的协同调控机制仍不明确。本项目将在网络水平上挖掘microRNA协同调控模块,并据此找到可靠的肾透明细胞癌联合诊断标记。内容包括:1)整合多层次的microRNA-gene调控关系,以优化的多元回归模型重构高质量的肾透明细胞癌特异的microRNA-gene调控网络;2)定义并挖掘网络中权重型microRNA功能协同调控模块,分析模块内协同microRNA的序列、结构和生物功能;3) 依据协同调控模块寻找肾透明细胞癌的microRNA联合诊断标记,评价其诊断效能,并进行下游生物学实验验证。本研究有助于深入理解肾透明细胞癌的分子合作调控机制,为发现可靠的诊断标志物提供新的手段。
中文关键词: 肾透明细胞癌;微小RNA;标记物;网络;模块
英文摘要: Early diagnosis of cancer is a difficult problem in the treatment of complex diseases. Its accurate diagnosis must consider regulatory cooperation between genes. MicroRNA provides potential biomarkers for cancer diagnosis. Currently the majority of work i
英文关键词: ccRCC;microRNA;marker;network;module