泛病原菌必需基因分布规律与必需型抗菌药靶的基础研究

项目名称： 泛病原菌必需基因分布规律与必需型抗菌药靶的基础研究

项目编号： No.31200991

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 林岩

作者单位： 天津大学

项目金额： 20万元

中文摘要： 当前细菌对抗生素耐药性的流行，引发了对新型抗菌药物的迫切需求。由于必需基因编码生命活动中不可或缺的功能，对病原菌必需型药物靶点的研究提供了开发新药的有效途径。本项目在细菌基因组数据不断涌现以及细菌间水平基因频繁转移的背景下，从病原的系统性和动态性角度考虑，统观不同必需基因在泛病原菌中的分布。通过完善综合同源性、功能性、序列特征的必需基因识别算法，预测泛病原菌的必需基因；基于构建的泛病原菌必需基因数据库，采用生物信息学的方法和工具，系统地分析泛病原菌中必需基因的分布规律，理解各类必需基因特别是核心必需基因与物种特异必需基因的生物学意义。整合新发现的知识并进行药靶初筛，以明确必需型抗菌药物靶点的基本特征，为不同抗菌谱的必需型药靶筛选算法的设计奠定基础。此项研究的实施有助于细菌必需基因概念的阐明，亦将有助于新作用机制的抗菌药物的开发与实现。

中文关键词： 必需基因；分布；泛病原菌；抗菌药靶；DEG 数据库

英文摘要： Infectious diseases caused by various pathogenic bacteria are considered to be a major public health problem globally. The recent emergence of antibiotic-resistant strains of many pathogens has focused the research on the identification of potential drug

英文关键词： Essential gene；Distribution；Pan-pathogenic bacteria；Antibacterial drug target；DEG database