项目名称: 2型糖尿病的生物分子网络动态行为与调控机理研究

项目编号: No.61134013

项目类型: 重点项目

立项/批准年度: 2012

项目学科: 自动化技术、计算机技术

项目作者: 陈洛南

作者单位: 中国科学院上海生命科学研究院

项目金额: 290万元

中文摘要: 糖尿病源自糖代谢系统紊乱,是一种涉及到动态分子网络调控的全身性复杂代谢疾病。本课题以2型糖尿病的发生、发展及手术治愈的动态过程为研究对象,利用系统生物学的理论计算和实验验证相结合的研究模式,建立其动态过程的生物分子网络的数学模型,研究其动力学性质和调控机理。(1)系统获取动物模型大鼠肠道的正常状态、糖尿病状态、手术后治愈状态和期间的多层次时间序列数据,并基于矩阵相关分析的框架对这些异源多层次进行集成分析。(2)集成实验产生的高通量数据及公开数据,以最优化和图模型为工具推断并整合2型糖尿病发生发展中的蛋白相互作用,基因调控网络和代谢网络。(3)对动态分子调控网络进行鲁棒性和可控性分析,整合及探测网络功能模块和活性通路,进行多稳态的动力学行为分析,得到表征糖尿病状态(正常,糖尿病,手术治愈)转化过程的关键调控因子和网络并进行实验验证,从网络层次揭示2型糖尿病发生与发展、预防与治疗的调控机制。

中文关键词: 系统生物学;网络标志物;动态网络标志物;高通量数据集成;多稳态

英文摘要:

英文关键词: systems biology;network biomarker;dyanamical network biomarker;omics data integration;multi-stability

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