项目名称: 剪接蛋白SRSF10在肠癌细胞增殖和凋亡中的作用
项目编号: No.31400677
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 生物科学
项目作者: 吴文武
作者单位: 中国科学院上海生命科学研究院
项目金额: 24万元
中文摘要: SRSF10是剪接调控蛋白,但与癌症发生是否相关不详。我们研究发现:SRSF10在肠癌细胞中表达上调,敲减SRSF10后细胞开始凋亡,表明SRSF10可能参与细胞增殖和(或)凋亡过程;但机制不明。本项目拟以SRSF10敲减和过表达的肠癌RKO细胞为两实验组,SRSF10正常表达为对照组,借助高通量测序技术,利用生物信息学方法,寻找受SRSF10调控的目的基因。其次,筛选出与细胞增殖和(或)凋亡相关的SRSF10目的基因,并进行QPCR、回补和CLIP等实验验证。最后,在前体mRNA 剪接调控水平上,阐述SRSF10调节肠癌细胞增殖和(或)凋亡的选择性剪接机制。综上,本课题拟寻找肠癌细胞增殖和凋亡中的SRSF10目的基因,研究其分子剪接作用,不仅可以在mRNA剪接调控水平上理解剪接蛋白调节细胞增殖和凋亡的分子机制;而且对于在细胞和分子水平上筛选针对肠癌或其它癌症的药物,也具有重要参考价值。
中文关键词: SRSF10;选择性剪接;转录组;剪接机理;可变剪接
英文摘要: SRSF10 functions as a general pre-mRNA splicing factor, but little is known about whether or not it is linked to cancer. Recently, our study indicated that: 1) SRSF10 was over-expressed in colorectal cancer cells, and 2) knocking down SRSF10 would induce
英文关键词: SR蛋白;alternative splicing;transcriptome;splicing module;motif