项目名称: 卵巢高丰度表达的新分子CRF相互作用蛋白的筛选及功能研究

项目编号: No.30900232

项目类型: 青年科学基金项目

立项/批准年度: 2010

项目学科: 轻工业、手工业

项目作者: 禹艳红

作者单位: 暨南大学

项目金额: 20万元

中文摘要: 卵巢是女性十分重要的器官,对妇女的生长、发育、生育、健康和生活起着关键性的作用。深入了解卵巢活跃表达的基因将有利于了解卵巢发育及相关疾病调控的分子机制。CRF是C1q家族的一员,与C1q具有相似的结构,前人研究认为CRF主要在脑部表达并参与神经分化。本课题组通过RT-PCR及测序分析首次发现CRF在高等哺乳动物的卵巢组织高丰度表达,进化分析发现在从头索动物到哺乳动物进化的5亿年时间历程中,CRF直系同源基因都在卵巢组织高表达,暗示CRF类基因在卵巢的发育成熟或者与卵巢相关的功能中的重要性。然而目前对于CRF作用机理的研究鲜有报道。为了更深入的了解CRF在卵巢组织中的作用机制,本项目拟以CRF成熟肽作为酵母双杂交系统中的"诱饵",筛选小鼠卵巢cDNA 文库,寻找与CRF相互作用蛋白,探寻CRF在卵巢组织中的作用机制,为更深入的了解卵巢的发育、卵巢相关的疾病发生及调控提供实验数据及新的思路。

中文关键词: CRF;相互作用;卵巢;颗粒细胞;凋亡

英文摘要:

英文关键词: CRF;interaction;ovary;granusola cell;apoptosis

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条件随机域(场)(conditional random fields,简称 CRF,或CRFs),是一种判别式概率模型,是随机场的一种,常用于标注或分析序列资料,如自然语言文字或是生物序列。 如同马尔可夫随机场,条件随机场为具有无向的图模型,图中的顶点代表随机变量,顶点间的连线代表随机变量间的相依关系,在条件随机场中,随机变量 Y 的分布为条件机率,给定的观察值则为随机变量 X。原则上,条件随机场的图模型布局是可以任意给定的,一般常用的布局是链结式的架构,链结式架构不论在训练(training)、推论(inference)、或是解码(decoding)上,都存在效率较高的算法可供演算。
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