基于高通量测序技术转录后调控复杂性进化模型及平台建立

项目名称： 基于高通量测序技术转录后调控复杂性进化模型及平台建立

项目编号： No.31401075

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 张绍军

作者单位： 哈尔滨医科大学

项目金额： 28万元

中文摘要： 物种间复杂表型差异的分子机制是物种进化研究的主要目标。序列和基因表达的进化研究显示人类及其相近物种共享大部分保守的DNA序列和基因表达模式，不足以解释物种间表型的巨大差异。怎样的分子机制是物种间复杂表型进化的驱动力呢？下一代测序技术的出现提供了不同物种中关于外显子、选择性剪切、转录本甚至等位表达的信息，提出了研究表型差异的新视角——转录后调控。本课题基于多物种多组织的RNA-seq数据采用混合效应统计模型构建转录后调控复杂性量化算法，在物种间比较其差异性和保守性；整合布朗运动、OU过程和最大似然估计构建转录后调控进化模型，筛选发生物种定向选择的基因，整合期望最大算法和热点延伸识别的转录后调控复杂性相关的DNA序列模体，阐明序列进化、调控复杂性和表型复杂性的进化机制。本课题开发的转录后调控复杂性进化分析算法平台，便于研究者系统地研究表型差异的分子机制，提供了物种进化研究的新方法。

中文关键词： 遗传变异；表观遗传；DNA甲基化；转录后调控；

英文摘要： Molecular mechanisms of enormous differences in complex phenotype among species is the main target of the evolutionary studies. Evolutionary studies of sequence and gene expression displayed that most DNA sequences and expression patterns of genes were co

英文关键词： genetic variation；epigenetics；DNA methylation；post transcriptional regulation；