基于距离的分子系统发育分析方法研究

项目名称： 基于距离的分子系统发育分析方法研究

项目编号： No.11171042

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 数理科学和化学

项目作者： 李春

作者单位： 渤海大学

项目金额： 45万元

中文摘要： 随着DNA测序技术的发展，越来越多的生物序列数据得以积累，这为从分子层次进行系统发育研究提供了条件，但也对现有的系统发育分析方法提出了挑战。本项目将深入研究分子系统发育分析的三个关键环节，从而改进传统并开发新的分子系统发育分析方法。主要包括：1)研究生物序列数据新的数学模型用于提取信息，并构造序列间在数学上严谨在实际应用中有效的、不依赖于多重序列比对的距离测度。2)研究基于距离的系统发育树重建算法本身存在的问题，特别是聚类过程中的距离调整问题，进而改进或整合部分基于距离的系统发育树重建算法。3)研究分子序列数据的不相合性，比较并改进不相合性检测方法，特别是要结合偏序关系和力的作用方式给出新的处理不相合分子数据的手段。同时，收集并整合相应实验数据，建立开放数据库。本项目所研究的是与国际研究同步的课题，无论是对于系统发育分析理论本身的发展，还是对其实际应用都具有相当重要的意义。

中文关键词： 系统发育分析；建树算法；数据分析；特征提取与选择；数学模型

英文摘要：

英文关键词： Phylogenetic analysis；Algorithm for phylogenetic tree construction；Data analysis；Extraction and selection of features；Mathematical models