水稻和高粱基因进化的比较基因组学分析

项目名称： 水稻和高粱基因进化的比较基因组学分析

项目编号： No.30971611

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 王希胤

作者单位： 河北联合大学

项目金额： 32万元

中文摘要： 多倍化在植物进化过程中广泛而反复发生；作为激变事件，可昼夜间改变物种的进化历程，创造大量重复基因，并在基因组长久保留，是遗传创新的重要材料来源。禾本科祖先发生了一次多倍化，其创造的重复基因依然大量存在于当今的禾本科物种的基因组中。高粱基因组测序完成为禾本科物种研究提供了新动力，为进行与水稻的比较基因组学分析和研究多倍化的长期影响提供了可能。本项目旨在利用进化理论的工具和方法，以水稻和高粱基因及其基因家族为研究对象，通过基因在染色体上的位置分析，确定共线性（Colinear）同源基因，结合外类群序列，考虑可能的基因反转(Gene conversion）,进行大规模的进化理论分析，构建基因系统发育树，研究两物种分歧前后，基因及其家族的进化规律，鉴定出在两物种间选择压力或进化速率显著不同的基因，鉴定出两物种中显示扩增或收缩的不同模式基因家族，研究相关生物学功能，初步探索多倍化对于物种分歧的影响

中文关键词： 禾本科；基因共线性；进化分析；DNA置换；非正常重组

英文摘要：

英文关键词： grass；gene colinearity；evolution；DNA conversion；illegitimate recombination