项目名称: 多肽定量构效关系的研究
项目编号: No.20975117
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 数理科学和化学
项目作者: 邹小勇
作者单位: 中山大学
项目金额: 35万元
中文摘要: 本课题以多肽类似物的定量构效关系(QSAR)为研究目的。根据多肽的氨基酸序列及编码氨基酸的密码子的相关特征,建立基于密码子的定量描述符。根据编码氨基酸的密码子的简并性,建立基于密码子的简并度的氨基酸序列参数。研究多肽聚类QSAR的建模技术,将聚类分析与多种建模方法融合,进行差异性大的样本集的QSAR研究。建立支持向量机与遗传算法和粒子群算法,以及支持向量机与协同快速模拟退火演化算法的联用技术,提高模型的预测性能。根据建立的模型,预测蜂毒肽类似物的溶血活性,结合生化分析等手段,研究溶血肽活性的结构特征以及影响因素,从结构、性质、分子极性等方面进行考察,为寻找和筛选优良活性肽等方面提供理论依据。本课题的研究将有助于更深入了解多肽结构与功能之间的相互关系,从分子水平上解释生命现象,对生命奥秘更深入的理解。这项新技术的开拓,必将丰富化学计量学和化学信息学内容,是信号分析与数据解析方法的一个创新。
中文关键词: 多肽;定量构效关系;聚类分析;密码子;简并度
英文摘要:
英文关键词: peptide;QSAR;cluster analysis;condon;degree of degeneracy