基于粒计算理论的生物网络结构建模、分析与算法研究

项目名称： 基于粒计算理论的生物网络结构建模、分析与算法研究

项目编号： No.11371174

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 数理科学和化学

项目作者： 唐旭清

作者单位： 江南大学

项目金额： 62万元

中文摘要： 本项目针对生物网络在获取基因组尺度上生物分子的结构与功能之间的信息关系方面发挥关键作用这一科学问题，采用理论研究与数据分析相结合的研究方法，系统开展粗粒化生物网络结构的建模、分析与算法研究。其核心研究内容包括以下三个方面：1、结合文献挖掘和基因组功能注释，利用代数拓扑方法进行生物网络结构信息粒度的数学描述；2、基于粒计算的结构聚类分析方法，构建粗粒化生物网络结构的数学模型；3、基于商空间链的路径规划模型，采用拓扑学理论和最优化方法，进行粗粒化生物网络中调控或代谢路径的计算与算法研究，建立粗粒化生物网络结构分析的理论与方法。结合实验数据，进行相关理论与方法的应用与比较研究。 本项目最终目标是构建一个完善的粗粒化生物网络结构分析的理论与方法，以获取基因组尺度上生物分子的结构与功能之间的信息关系，达到揭示生物分子的调控和代谢机制的目的。

中文关键词： 粒计算；生物网络；结构分析；优化模型；算法设计

英文摘要： In view of the fact that the biological networks becomes more and more important in extracting the relationship between the structures and corresponging functions of biological molecules at the genome-scale, this project will systematic study the mathemat

英文关键词： granular computing；biological network；structural analysis；optimizing model；algorithm design