项目名称: 融合多种信息识别激酶特异的蛋白质磷酸化位点
项目编号: No.60905014
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 生物科学
项目作者: 李婷婷
作者单位: 北京大学
项目金额: 18万元
中文摘要: 蛋白质磷酸化是蛋白质组学研究中的重要内容,本项目研究融合蛋白质结构、功能域组成、相互作用等多种信息识别激酶特异的磷酸化位点。蛋白质磷酸化是蛋白质翻译后修饰的一种,它参与细胞中众多的生命活动过程,对调控蛋白质的生物活性起着至关重要的作用。蛋白质磷酸化位点预测是生物信息学研究中的热点问题,从1999年第一个基于磷酸化位点周围的氨基酸序列进行预测的方法开始,后续工作多是通过尝试应用新的机器学习方法实现预测准确率的提高。蛋白质磷酸化过程受到多种因素影响,磷酸化位点周围的氨基酸序列并不能完全决定磷酸化是否发生。在这种情况下,仅仅依靠改进模式识别算法,提升预测性能的空间已经非常有限。所以,我们尝试从另一方面着手,在氨基酸序列基础上,融合蛋白质结构、功能域、亚细胞定位、相互作用等新信息进行磷酸化位点预测。我们期待能够通过本项目,探索蛋白质磷酸化位点预测问题的新道路,同时也为其他蛋白质修饰研究提供借鉴。
中文关键词: 生物信息学;蛋白质磷酸化;蛋白质乙酰化;特异;
英文摘要:
英文关键词: Bioinformatics;Protein phosphorylation;Protein acetylation;specific;