蛋白质亚核定位及其特征信息的理论研究

项目名称： 蛋白质亚核定位及其特征信息的理论研究

项目编号： No.31360206

项目类型： 地区科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 李凤敏

作者单位： 内蒙古农业大学

项目金额： 50万元

中文摘要： 本项目在已有的蛋白质亚细胞定位数据库基础上，整合核定位蛋白数据库（The Nuclear Protein Database ）中的核定位蛋白，进一步构建和完善核定位蛋白和非核定位蛋白数据子库及多定位蛋白质亚核定位数据子库。深入分析不同亚核定位蛋白所包含的特征模体、化学位移、蛋白质相互作用信息，并提取与蛋白质亚核定位相关的蛋白质特征信息参数，完善基因本体（GO）信息的提取方法，将传统的蛋白质氨基酸组份、物理化学性质信息与这些信息参数相结合，利用离散增量和协变判别式进行特征信息参数的组合，寻找最佳组合参数，提出预测模型，首先识别核定位蛋白和非核定位蛋白，然后再对核定位蛋白的亚核定位进一步预测，并给出预测多定位蛋白亚核定位的有效模型和理论。根据预测结果不断改进和完善特征信息参数的选取和预测算法，提高蛋白质亚核定位的预测能力。为进一步的实验研究提供理论指导，为蛋白质生物学功能的研究提供帮助。

中文关键词： 核定位；蛋白质；数据库；特征信息；预测

英文摘要： On the basis of protein subcellular localization database, the subnuclear protein of the Nuclear Protein Database was integrated. Further, the nuclear and non-nuclear protein sub-database was built and a dataset consisting of proteins with multi-localizat

英文关键词： nuclear localization；protein；database；feature information；prediction