基于蛋白质空间结构的乙酰化位点两步预测新方法研究

项目名称： 基于蛋白质空间结构的乙酰化位点两步预测新方法研究

项目编号： No.61401302

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 无线电电子学、电信技术

项目作者： 张宁

作者单位： 天津大学

项目金额： 26万元

中文摘要： 蛋白质赖氨酸的乙酰化是一种重要的翻译后修饰（PTM），在细胞生命活动中发挥举足轻重的作用，并参与着包括肿瘤在内的多种病理过程。发展理论预测乙酰化位点的方法，是乙酰化研究的迫切需要和当前生物信息学的前沿热点课题，具有重要的生物学意义。本课题旨在开发一种崭新的乙酰化位点预测方法，其突出特点是：（1）预测过程分两步进行，结合系统生物学的方法首先预测乙酰化的蛋白，然后再预测乙酰化位点；（2）将整合真正意义的蛋白质空间结构特征；（3）使用单类分类模型，克服正负样本不均衡的问题。该方法不仅体现了突出的科学创新性，而且有较充分的理论和实验根据，为模块化准确预测乙酰化位点提供可能。还将对模型所用的最优特征集进行生物学分析，探讨乙酰化的机制和影响因素。其研究成果可为乙酰化鉴定实验和新乙酰化蛋白的发现提供指导方向，为基于乙酰化位点的生物学研究提供有价值的参考，更可为其他PTM类型的预测模型提供新的发展思路。

中文关键词： 蛋白质；乙酰化；翻译后修饰；特征筛选；数据库

英文摘要： Protein lysine acetylation is one of the most important post-translational modifications (PTMs), which plays a vital role in a wide variety of crucial cellular functions and is involved in several important diseases such as cancer. There is a growing need

英文关键词： protein；acetylation；post-translational modification；feature selection；database