融合DNA三维结构信息的真核转录调控研究

项目名称： 融合DNA三维结构信息的真核转录调控研究

项目编号： No.61202343

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 戴智明

作者单位： 中山大学

项目金额： 28万元

中文摘要： 转录调控是基因调控的一个重要部分。用计算方法揭示转录调控机理是研究的热点。传统的方法主要是基于DNA一维序列，而忽略了DNA三维结构对转录调控的贡献。本课题使用计算方法结合多种DNA三维结构信息到真核生物转录调控的研究中。探索物种内与物种间转录因子结合位点在DNA结构上的进化保守性问题。基于DNA结构信息，开发计算方法来查找转录因子结合位点，查找结果可以提供转录因子结合位点的DNA结构特征信息。使用贝叶斯网络建立转录因子结合位点的DNA结构特征与基因表达之间的定性映射模型，并基于该模型，进一步建立它们之间的定量调控关系。对更全面地阐明真核基因转录调控的复杂机制有重要意义，为具体了解生物细胞的代谢过程奠定基础。

中文关键词： 转录因子；DNA三维结构；环状基因；细胞核三维结构；位置相邻基因

英文摘要： Transcriptional regulation is an important part of gene regulation. Computational understanding of transcriptional regulation mechanisms is an active field of research. Conventional methods are mainly based on primary DNA sequence, and ignore the contribu

英文关键词： Transcription factor；DNA three-dimensional structure；Looped gene；Three-dimensional nuclear structure；Neighboring Genes