基于分子柔性和动力学信息的蛋白质折叠机理研究

项目名称： 基于分子柔性和动力学信息的蛋白质折叠机理研究

项目编号： No.10974008

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 数理科学和化学

项目作者： 王存新

作者单位： 北京工业大学

项目金额： 36万元

中文摘要： 蛋白质分子本身所固有的拓扑结构和动力学特性对于蛋白质折叠和蛋白质-蛋白质相互作用与识别具有重要的影响。本项目旨在采用弹性网络模型和Gō27169;型，结合正则模分析、随机动力学、蒙特卡罗模拟以及全原子分子动力学模拟，从动力学的角度，考察蛋白质天然结构的柔性，建立有效刻画蛋白质分子局部和整体结构柔性的物理参量，探讨蛋白质结构柔性与蛋白质折叠/去折叠事件的次序以及折叠速率之间的内在联系，通过对蛋白质柔性分析来识别折叠核，为揭示蛋白质折叠/去折叠的机理以及蛋白质-蛋白质相互作用与识别的机制提供有益的探索，并将蛋白质结构柔性分析方法用于蛋白质-蛋白质对接研究，为建立基于蛋白质结构柔性分析的蛋白质-蛋白质柔性对接方法打下坚实的基础。

中文关键词： 蛋白质折叠机理；分子柔性；弹性网络模型；分子模拟；分子对接

英文摘要：

英文关键词： protein folding mechanism；molecular flexibility；elastic network model；molecular modelling；molecular docking