项目名称: 基于LD作图的油茶不饱和脂肪酸含量变异位点研究
项目编号: No.31400580
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 农业科学
项目作者: 林萍
作者单位: 中国林业科学研究院亚热带林业研究所
项目金额: 25万元
中文摘要: 油茶是我国重要木本油料树种,其种子油(74%~87%为油酸)是高档保健食用油。利用油酸、亚油酸含量差异显著的种质资源,筛选与茶油品质关联的分子标记对油茶育种具有重要意义。本研究基于前期构建的涵盖全分布区遗传资源的油茶群体(250个以上)及杂交F1代群体(300个以上),通过测序、毛细管电泳和Illumina基因分型法挖掘油茶油酸去饱和酶基因区域内(包括启动子、5' UTR、内含子、外显子、和3' UTR)SSR、SNP位点和基因分型;采用最大似然法分析单体型频率,统一混合模型法分析标记、单体型与表型性状的关联性;并进一步在F1代群体中验证,同时利用qRT-PCR法探析多态性位点是否调控基因的转录水平。通过研究,确定油茶基因组连锁不平衡(LD)延伸模式,获得油酸去饱和酶基因与油茶品质关联的标记位点或单体型,探明其对表型变异的基因效应,为LD作图用于油茶MAS育种的可行性和准确性提供科学依据。
中文关键词: 油茶;连锁不平衡;油脂品质;多态性位点;关联分析
英文摘要: Camellia oleifera, as an important non-wood tree species for seed oil in China, has received more attentions owing to its higher unsaturated fatty acid contents benefited to human health. It is necessary to obtain the molecular markers, which is associate
英文关键词: Camellia oleifera;linkage disequilibrium;oil quality;polymorphic sites;association analysis