项目名称: miR528参与调控水稻砷耐性的分子机理研究

项目编号: No.31471431

项目类型: 面上项目

立项/批准年度: 2015

项目学科: 食品科学、农学基础与作物学

项目作者: 刘庆坡

作者单位: 浙江农林大学

项目金额: 87万元

中文摘要: 砷污染严重影响水稻的产量、品质和人类健康。提高水稻的砷耐受性是解决水稻砷污染有效途径之一。但目前仅有少数基因被发现或与水稻的砷耐性有关。我们发现,在耐砷品种日本晴中过表达miR528后可使其砷耐性极显著下降。项目瞄准水稻砷污染和miRNA研究热点,拟在前期研究基础上,综合运用RACE、RNA-Seq测序、启动子融合GUS、转基因、SRXRF技术等,经过表达和抑制表达miR528,探明其与水稻砷耐性的关系;通过生物信息预测、RACE验证、miR528敏感和不敏感的靶基因过表达转基因及与miR528过表达植株杂交等,鉴定出在砷胁迫下受到miR528调控的主作用靶基因;原位解析miR528和主作用靶基因作用的组织部位和时期;明晰由其介导水稻砷耐受的细胞学基础和生理特征,以此阐明miR528与主作用靶基因调控水稻砷耐性的作用机理,从而为加深水稻-砷互作关系认识及水稻抗逆育种提供新思路和新靶标基因。

中文关键词: 水稻;miRNA;砷;功能;分子机制

英文摘要: The production and quality of rice as well as human health are severely challenged by environmental arsenic exposure. Growing evidence shows that one of the effective ways to resolve rice arsenic exposure is to enhance the rice plants ability to arsenic tolerance. However, only a few of protein-coding genes with potential relevance with arsenic tolerance have been identified in rice so far. In our previous studies, we found that transgenic plants containing the over-expression miR528 vector become significantly more sensitive to arsenite than the wide-type japonica rice Nipponbare that is tolerant to arsenite, suggesting that this gene may participate in the processes of arsenic responses in rice. In this project, taking the rice arsenic pollution and miRNA gene studies into consideration, we want to further uncover the biological function of miR528 in regulation of rice arsenite tolerance and the underlying molecular mechanisms on the basis of our previous results, using the combination of approaches of RACE, RNA-Seq high-throughput sequencing, GUS reporter gene fusion, gene transformation, and SRXRF technology, etc. To this end, a construct expressing the target mimicry MIM528 will have been constructed firstly. Using the functional complementary experiments, we want to clearly clarify the relationships between miR528 and arsenite tolerance by comparing the phenotypes of transgenic plants over-expressing miR528 (OE-miR528) and MIM528 (OE-MIM528) under arsenite stress. Secondly, we want to have identified one or several miR528 target genes that play most important roles in regulation of rice arsenite tolerance (termed critical targets), by combinations of in silico prediction, RACE validation, target genes transformation with either the normal or engineered coding sequences, as well as hybridization with OE-miR528 plants, etc. Thirdly, the temporal and spatial expression patterns of miR528 and its critical target genes will have been in situ explored using the fusion of GUS reporter gene. Lastly, using the transgenic and wild-type rice plants as materials, the microstructure of root and stem cells will have been photographed and compared, as well the distribution of arsenic and copper in different tissues, when the plants are cultivated under normal circumstance and arsenite stress, respectively. In addition, the physiological characteristic and ability in arsenic efflux of different genotypes will have been investigated and compared. Taken together, we attempt to disclose the molecular mechanisms of arsenic tolerance mediated by miR528 and its critical targets in rice. The results expected would deepen our knowledge in further understanding the interactions between rice and arsenic. On the other hand, it would be informative and significative for stress-resistant crop breeding or improvement in rice by supplying a mount of novel gene resources.

英文关键词: Rice;miRNA;Arsenic;Function;Molecular mechanism

成为VIP会员查看完整内容
0

相关内容

ICLR2022 | OntoProtein:融入基因本体知识的蛋白质预训练
专知会员服务
28+阅读 · 2022年2月20日
【AAAI2022】利用神经检索器改进生物医学信息检索
专知会员服务
16+阅读 · 2022年1月21日
数据价值释放与隐私保护计算应用研究报告,64页pdf
专知会员服务
39+阅读 · 2021年11月29日
专知会员服务
52+阅读 · 2021年10月1日
专知会员服务
26+阅读 · 2021年8月13日
【WWW2021】多视角图对比学习的药物药物交互预测
专知会员服务
53+阅读 · 2021年1月29日
【NeurIPS 2020】视觉注意力神经编码
专知会员服务
40+阅读 · 2020年10月4日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2008年12月31日
Arxiv
0+阅读 · 2022年4月15日
Arxiv
1+阅读 · 2022年4月15日
Arxiv
28+阅读 · 2022年3月28日
Arxiv
46+阅读 · 2021年10月4日
Arxiv
19+阅读 · 2021年6月15日
小贴士
相关主题
相关VIP内容
ICLR2022 | OntoProtein:融入基因本体知识的蛋白质预训练
专知会员服务
28+阅读 · 2022年2月20日
【AAAI2022】利用神经检索器改进生物医学信息检索
专知会员服务
16+阅读 · 2022年1月21日
数据价值释放与隐私保护计算应用研究报告,64页pdf
专知会员服务
39+阅读 · 2021年11月29日
专知会员服务
52+阅读 · 2021年10月1日
专知会员服务
26+阅读 · 2021年8月13日
【WWW2021】多视角图对比学习的药物药物交互预测
专知会员服务
53+阅读 · 2021年1月29日
【NeurIPS 2020】视觉注意力神经编码
专知会员服务
40+阅读 · 2020年10月4日
相关基金
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2008年12月31日
微信扫码咨询专知VIP会员