用定量差异共表达分析策略研究复杂疾病相关的异常调控机制

项目名称： 用定量差异共表达分析策略研究复杂疾病相关的异常调控机制

项目编号： No.31171268

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 遗传学与生物信息学、细胞生物学

项目作者： 李园园

作者单位： 上海生物信息技术研究中心

项目金额： 50万元

中文摘要： 识别疾病相关的异常基因转录调控关系是疾病分子机制研究中的核心问题。虽然近年来转录组检测技术的普及为疾病研究带来了极大便捷，但目前仍然缺乏直接针对该问题的数据挖掘技术。基于近几年兴起的差异共表达分析技术，有希望发展出有效的解决方案。然而由于差异共表达分析方法设计上的缺陷，目前鲜有将该研究思想直接应用于疾病相关异常调控机制的挖掘。在前期工作中，我们发展了定量的差异共表达分析方法，克服了当前方法学上的主要缺陷。本课题首先将进一步优化差异共表达分析算法，在此基础上综合差异表达、差异共表达等多种基因表达属性，引入调控相关的生物学知识，发展差异调控关系识别算法。随后将新方法应用于典型的复杂疾病II型糖尿病（T2D），识别其异常调控关系，推进发病机制研究。最后，从多种复杂疾病的转录组数据出发，基于异常调控机制的相似度计算疾病之间的距离，为复杂疾病机理的研究、治疗策略的发展提供新的视角和有价值的数据资源。

中文关键词： 表达相关性；转录调控；差异共表达分析；差异调控分析；人类疾病网络

英文摘要：

英文关键词： expression correlation；transcriptional regulation；differential coexpression analysis；differential regulation analysis；human disease network