利用进化印迹鉴定水稻基因组的功能元件

项目名称： 利用进化印迹鉴定水稻基因组的功能元件

项目编号： No.31371284

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 陈明生

作者单位： 中国科学院遗传与发育生物学研究所

项目金额： 80万元

中文摘要： 鉴定具有生物学功能的基因组序列，并阐述其生物学意义是基因组研究的重要目标。多个物种的比较基因组学分析表明，基因组在进化过程中，功能性序列由于受到纯化选择的压力，一般趋向保守。因此，鉴定出受到进化约束的序列是开展基因组功能元件分析的重要基础。水稻基因组是植物基因组研究中的重要参考基因组。稻属多个代表物种基因组测序的完成，为分析水稻基因组保守的功能性序列提供了理想的研究系统。本研究计划旨在利用稻属8个基因组，通过比较基因组学、计算生物学和进化模型相结合，鉴定水稻基因组内受到进化约束的基因组序列，并利用进化印迹特征发现水稻基因组的功能元件。

中文关键词： 稻属；比较基因组学；计算生物学；基因组进化；进化约束

英文摘要： Identifying the functional sequences and clearly expatiating the underlying biological significance are the fundamental goals in genomic analysis. Multiple species comparisons suggest that functional sequences are more conserved than nonfunctional parts,

英文关键词： Oryza；comparative genomics；computational biology；genome evolution；evolutionary constraint