番茄miRNA及其靶基因的挖掘与鉴定

项目名称： 番茄miRNA及其靶基因的挖掘与鉴定

项目编号： No.31171971

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 生物科学

项目作者： 栾雨时

作者单位： 大连理工大学

项目金额： 10万元

中文摘要： miRNA是生物体内普遍存在的单链非编码RNA分子，在转录后水平通过介导靶mRNA降解或翻译抑制调控基因表达，进而在植物的生长发育、适应生物和非生物胁迫等方面起着重要的作用。目前在miRBase中登录的番茄miRNA仅有30个，相关报道甚少，制约了番茄分子生物学研究的进度。本项目在采用比较基因组学方法初步预测了番茄miRNA的基础上，拟通过基于支持向量机模型的分类算法结合高通量测序及实时定量PCR、分子杂交、质谱分析等技术手段，挖掘、鉴定符合标准的新的番茄miRNA及其靶基因；揭示二者之间的关系；构建植物表达载体，用前体miRNA及其靶基因转化番茄，创制转基因资源材料；探明各外源基因对主要农艺性状的作用；从中选出抗病抗逆的株系。为番茄遗传育种及栽培生理方面的研究奠定基础；在丰富miRBase的同时也为miRNA及其靶基因的挖掘与鉴定开辟一条便捷的途径。

中文关键词： 番茄；微小RNA；靶基因；生物信息；

英文摘要：

英文关键词： tomato；microRNA；Target genes；Bioimformation；