转录组的单核苷酸多态性（SNPs）与蜈蚣草砷富集能力的关系

项目名称： 转录组的单核苷酸多态性（SNPs）与蜈蚣草砷富集能力的关系

项目编号： No.30900158

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 金属学与金属工艺

项目作者： 杨兵

作者单位： 中山大学

项目金额： 22万元

中文摘要： 蜈蚣草（Pteris vittata）是世界上第一个被发现的砷（As）超富集植物。尽管不同来源的蜈蚣草都被证实具有As超富集特征，但它们的富集能力差异显著。为探讨这种差异的分子基础，本项目拟应用454 GS-FLX测序平台，对中国典型As污染区和正常土壤中自然分布的蜈蚣草叶mRNA进行深度测序，通过序列拼接和比对发掘蜈蚣草转录组内编码区单核苷酸多态性（cSNPs）。在此基础上，根据COG及KEGG系统对这些cSNPs进行功能群分类，并对同一功能群中杂合度高的cSNPs进行基因分型和验证。基于验证通过的cSNPs的基因分型，通过聚类及相关性分析建立SNPs与As富集能力的关系，为探索植物As超富集机制及代谢途径提供大量有关联的基因资源。

中文关键词： 蜈蚣草；超富集植物；地理隔离；多样性；砷

英文摘要：

英文关键词： Arsenic (As)；genetic polymorphism；geographic origin；hyperaccumulator；Pteris vittata