基于群体组学的猪体长性状重要基因鉴定及进化分析

项目名称： 基于群体组学的猪体长性状重要基因鉴定及进化分析

项目编号： No.31372275

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 农业科学

项目作者： 方美英

作者单位： 中国农业大学

项目金额： 82万元

中文摘要： 驯化和品种培育形成了体长性状各异的猪品种。猪体长是多基因控制的复杂性状，与产肉量具有明显正相关，是猪种改良的重要经济性状之一。申请人前期完成了杜洛克猪体长性状全基因组关联分析，鉴定了染色体1、7、8、13和14上与体长性状显著相关的基因组区段。本项目拟在前期基础上，综合群体组学信息进一步在上述区段精细定位猪体长性状重要基因及SNPs。实验拟选取我国特有小体型海南五指山猪，另以当地海南野猪和商用大体型杜洛克猪为对照，通过RNA-seq对上述猪种进行深度表达谱分析，揭示其转录组差异；同时结合体长差异群体selective sweep分析结果，缩小体长性状相关基因组区段；进一步综合特征群体重测序单倍型数据，从群体基因组和转录组水平精细定位猪体长性状重要基因及SNPs，并进行不同猪种候选基因及SNPs分子遗传特性和进化分析。研究结果将为体长性状变异的分子机制解析及猪体长性状的分子选育提供科学依据。

中文关键词： 猪；体长性状；基因组关联分析；转录组测序；功能基因

英文摘要： Pig breeds with varied body length were formed during domestication and breed development. The body length is a polygenic complex trait, which is close positive association with the carcass weight and it is one of important target traits in pig breeding.

英文关键词： pig；body length traits；GWAS；RNA-seq；functional gene