项目名称: 恒河猴功能基因组学研究与专家数据库构建及其在代谢综合症机制研究中的应用

项目编号: No.31171269

项目类型: 面上项目

立项/批准年度: 2012

项目学科: 遗传学与生物信息学、细胞生物学

项目作者: 李川昀

作者单位: 北京大学

项目金额: 40万元

中文摘要: 恒河猴作为重要的灵长类模式动物,在疾病机制研究、药物临床前评估及分子演化等多个领域发挥重要作用。然而,受灵长类资源短缺、疾病模型构建困难等因素限制,目前恒河猴功能基因组学研究还不够深入,缺乏对注释信息的有效整合,对基因及其调控关系的注释缺乏系统性,严重制约着相关领域的基础与应用研究。本项目拟结合新一代测序技术,通过健康恒河猴多组织、多个体的转录谱研究,完善现有恒河猴功能基因组学注释。并通过生物信息学数据整合,进一步系统整合已发表的恒河猴注释信息,结合自产数据,建立完善的恒河猴数据库注释系统RhesusBase,从遗传、表达、调控等多个角度阐述恒河猴基因结构与功能。最后,在上述工作基础上,利用前期已建立的恒河猴代谢综合症疾病模型,开展基于深度测序的系统生物学研究,发现在代谢综合症发生发展中灵长类特异的调控关系,完善对代谢综合征生理病理及其调控机制的整体认识,为探寻新的治疗靶点提供理论基础。

中文关键词: 恒河猴;基因组学;生物信息学;数据库;分子演化

英文摘要:

英文关键词: Rhesus Macaque;Genomics;Bioinformatics;Database;Molecular Evolution

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