水稻全基因组启动子序列分离及其组蛋白修饰特征分析

项目名称： 水稻全基因组启动子序列分离及其组蛋白修饰特征分析

项目编号： No.31371239

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 张文利

作者单位： 南京农业大学

项目金额： 80万元

中文摘要： 启动子是基因表达调控的必要元件。植物启动子在全基因组水平的鉴定及其结构与功能分析，不仅对阐述与基因表达调控相关的基本理论问题具有重要的参考价值，而且为植物基因工程中启动子的选择与人工改造提供理论依据。本项目首先运用DNase-seq同时结合mRNA-seq, 在全基因组水平上鉴定水稻幼苗、幼根、幼穗及愈伤等四种组织的组成型、双向及组织特异性启动子，全面分析其结构与功能的内在联系；其次，结合组蛋白修饰的ChIP-seq数据，探讨启动子周围核小体的组蛋白修饰特征与基因表达的关系；最后，选取部分具有DNaseI印迹的各类启动子进行转基因验证。预期研究成果将有助于我们了解启动子的DNA序列结构及组蛋白修饰与基因高效或特异表达的关系，深化人们在启动子水平对基因表达调控的机制的认识。同时，也有利于水稻转基因工程与分子育种中对特异启动子的选择与利用。

中文关键词： 启动子；基序；组蛋白修饰；功能验证；水稻

英文摘要： Promoters are the essential elements for regulating gene expression. Genome-wide identification of plant promoters and analysis of their structures and functions will not only provide important reference values to elaborate basic theories related to regu

英文关键词： Promoters；Motifs；Histone modifications；Functional validation；Rice