项目名称: 延边地区汉族和朝鲜族人群原发性肝癌与其相关Poly-miRTS的关联性研究

项目编号: No.31460284

项目类型: 地区科学基金项目

立项/批准年度: 2015

项目学科: 生物科学

项目作者: 崔鹤松

作者单位: 延边大学

项目金额: 50万元

中文摘要: 延边地区是以汉族和朝鲜族为主要聚居民族的边疆少数民族地区,且不同民族间的遗传背景、生活方式及饮食习惯有很大差异。流行病学调查发现,延边地区原发性肝癌的发病率呈逐年上升趋势,存在民族差异。现已公认肝癌的发生与遗传、病毒和环境因素密切相关;课题组前期应用miRanda和RNAhybrid预测软件,结合SNP和miRNA数据库筛选出野生型和变异型等位基因与miRNA结合能差异 (|??G|)大于5.27 KJ/mol的26个Poly-miRTS。因此,本课题设计研究上述Poly-miRTS、病毒和环境因素的交互作用对汉族和朝鲜族人群原发性肝癌易感性、介入后2年生存率和疗效的影响,并通过荧光素酶检测和qRT-PCR等方法鉴定miRNA对靶标的影响,探讨miRNA对不同基因型的调控作用,合理解释朝鲜族原发性肝癌高发的原因,为早期筛选肝癌高危人群、一级预防以及早期临床干预等提供理论基础。

中文关键词: 预测软件;Poly-miRTS;miRNA;原发性肝癌;结合能

英文摘要: Yanbian area is a frontier minority region where Han and Korean Chinese are living together with different genetic background and eating habits. It has been reported that the incidence of Primary Hepatocellular Carcinoma(PHC) is incresing in Yanbian area, and showing national differences. The development of PHC is related to genetic background,virus infection and environment factors. We have screened 26 poly-miRTS(Difference [(|??G|) ≥5.27 KJ/mol] ) from SNP and miRNA database by using predicting software like miRanda and RNAhybrid. In this study, we will investigate the interaction of poly-miRTS, virus infection and environment factors to the incidence of PHC, two year survival after interventional therapy and prognosis in Han and Korean Chinese patients. Furthermore, we will test the effect of miRNA on target mRNA by using luciferase assay and qRT-PCR, discuss the regulation of miRNA to different genotype, explain the reason of higher incidence of PHC in Korean-Chinese population. This will provide the theoretical basis for early screening of high risk population, primary prevention of PHC, and the early clinical intervention.

英文关键词: predicting software;Poly-miRTS;miRNA;PHC;binding energy

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