本教程全面调查了用于微调扩散模型以优化下游奖励函数的方法。虽然扩散模型因其出色的生成建模能力广为人知,但在生物学等领域的实际应用中,需要生成最大化某些期望指标(如RNA的翻译效率、分子的对接评分、蛋白质的稳定性)的样本。在这些情况下,扩散模型不仅可以生成逼真的样本,还可以明确地最大化感兴趣的度量。这些方法基于强化学习(RL)的概念。我们解释了各种RL算法的应用,包括PPO、可微优化、奖励加权最大似然估计(MLE)、价值加权采样和路径一致性学习,这些算法专门用于微调扩散模型。我们旨在探索基本方面,例如不同RL微调算法在各种场景中的优缺点、RL微调相对于非RL方法的好处,以及RL微调的正式目标(目标分布)。此外,我们还将探讨它们与相关主题的联系,如分类器指导、Gflownets、基于流的扩散模型、路径积分控制理论和从非标准化分布(如MCMC)中采样。本教程的代码可在https://github.com/masa-ue/RLfinetuning Diffusion Bioseq获得。

扩散模型(Sohl-Dickstein等,2015;Ho等,2020;Song等,2020)被广泛认为是强大的生成建模工具。它们能够通过紧密模拟训练数据的特征来准确地建模复杂的分布。扩散模型在多个领域有许多应用,包括计算机视觉(Podell等,2023)、自然语言处理(Austin等,2021)、生物学(Avdeyev等,2023;Stark等,2024;Li等,2023)、化学(Jo等,2022;Xu等,2022;Hoogeboom等,2022)以及生物学(Avdeyev等,2023;Stark等,2024;Campbell等,2024)。尽管扩散模型在捕捉训练数据分布方面表现出显著的能力,但常常需要根据特定的下游奖励函数对这些模型进行定制。例如,在计算机视觉领域,Stable Diffusion(Rombach等,2022)作为一个强大的预训练模型骨干,但我们可能希望通过优化下游奖励函数(如美学评分或人类对齐评分(Black等,2023;Fan等,2023))来进一步微调它。同样,在生物学和化学等领域,已经开发出各种复杂的扩散模型用于DNA、RNA、蛋白质序列和分子,有效地建模生物和化学空间。然而,生物学家和化学家通常旨在优化特定的下游目标,如DNA序列中的细胞特异性表达(Gosai等,2023;Lal等,2024;Sarkar等,2024)、RNA序列的翻译效率/稳定性(Castillo-Hair和Seelig,2021;Agarwal和Kelley,2022)、蛋白质序列的稳定性/生物活性(Frey等,2023;Widatalla等,2024)或分子的QED/SA评分(Zhou等,2019)。为了实现这一目标,已经提出了许多通过强化学习(RL)微调扩散模型的算法(如Black等,2023;Fan等,2023;Clark等,2023;Prabhudesai等,2023;Uehara等,2024),旨在优化下游奖励函数。RL是一种机器学习范式,代理通过学习进行顺序决策以最大化奖励信号(Sutton和Barto,2018;Agarwal等,2019)。在我们的背景下,RL由于扩散模型固有的顺序结构,自然而然地成为一种合适的方法,其中每个时间步涉及一个“决策”,对应于该步样本的去噪方式。本教程旨在回顾最近的研究成果,为对从整体角度理解基于RL的微调基础知识感兴趣的读者提供帮助,包括基于RL的微调相对于非RL方法的优势、不同RL微调算法的优缺点、RL微调的正式目标及其与分类器指导等相关主题的联系。本教程的内容主要分为三个部分。此外,作为实现示例,我们还发布了利用RL微调进行引导的生物序列(DNA/RNA)生成的代码,地址为:https://github.com/masa-ue/RLfinetuning Diffusion Bioseq。

  1. 我们旨在提供当前算法的全面概述。特别是,鉴于扩散模型的顺序特性,我们可以自然地将微调框架为马尔可夫决策过程(MDP)中的强化学习(RL)问题,如第3和第4节所述。因此,我们可以采用任何现成的RL算法,例如PPO(Schulman等,2017)、可微优化(直接奖励反向传播)、加权MLE(Peters等,2010;Peng等,2019)、价值加权采样(类似于Dhariwal和Nichol(2021)中的分类器指导)以及路径一致性学习(Nachum等,2017)。我们在第4.2和第6节详细讨论了这些算法。我们不仅仅列出每个算法,还旨在呈现它们的优缺点,以便读者可以根据自己的具体目的选择最合适的算法。

  2. 我们在第7节根据奖励反馈的获取方式分类了各种微调场景。这一区分对实际算法设计至关重要。例如,如果我们可以获得准确的奖励函数,计算效率将成为我们的主要关注点。然而,在奖励函数未知的情况下,必须从具有奖励反馈的数据中学习它们,从而需要考虑反馈效率和分布转移的问题。特别是,当需要从静态离线数据中学习奖励函数而没有任何在线交互时,我们必须解决过度优化的问题,即微调模型被分布外样本误导,生成低真实奖励的样本。这一点非常重要,因为在离线场景中,具有反馈的离线数据分布的覆盖范围有限,因此分布外区域可能非常广泛(Uehara等,2024)。

  3. 我们详细讨论了基于RL的微调方法与文献中密切相关的方法之间的关系,如第8节中的分类器指导(Dhariwal和Nichol,2021)、第9节中的基于流的扩散模型(Liu等,2022;Lipman等,2023;Tong等,2023)、第10节中的非标准化分布采样(Zhang和Chen,2021)、第6.3节中的Gflownets(Bengio等,2023)以及第6.2.3节中的路径积分控制理论(Theodorou等,2010;Williams等,2017;Kazim等,2024)。我们总结了以下关键信息:

  • 第6.3节:Gflownets中使用的损失本质上等同于从一种特定RL算法——路径一致性学习中导出的损失。
  • 第8节:在条件生成中使用的分类器指导被视为一种特定的基于RL的微调方法,我们称之为价值加权采样。正如Zhao等(2024)中形式化的那样,这一观察表明,任何现成的基于RL的微调算法(如PPO和可微优化)都可以应用于条件生成。
  • 第10节:从非标准化分布(通常称为吉布斯分布)中采样在各个领域都是一个重要且具有挑战性的问题。尽管MCMC方法传统上用于解决这一任务,但认识到其与基于RL的微调目标的相似性,表明现成的RL算法也可以有效地解决从非标准化分布中采样的挑战。

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强化学习(RL)是机器学习的一个领域,与软件代理应如何在环境中采取行动以最大化累积奖励的概念有关。除了监督学习和非监督学习外,强化学习是三种基本的机器学习范式之一。 强化学习与监督学习的不同之处在于,不需要呈现带标签的输入/输出对,也不需要显式纠正次优动作。相反,重点是在探索(未知领域)和利用(当前知识)之间找到平衡。 该环境通常以马尔可夫决策过程(MDP)的形式陈述,因为针对这种情况的许多强化学习算法都使用动态编程技术。经典动态规划方法和强化学习算法之间的主要区别在于,后者不假设MDP的确切数学模型,并且针对无法采用精确方法的大型MDP。

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