Kinetic equations are crucial for modeling non-equilibrium phenomena, but their computational complexity is a challenge. This paper presents a data-driven approach using reduced order models (ROM) to efficiently model non-equilibrium flows in kinetic equations by comparing two ROM approaches: Proper Orthogonal Decomposition (POD) and autoencoder neural networks (AE). While AE initially demonstrate higher accuracy, POD's precision improves as more modes are considered. Notably, our work recognizes that the classical POD-MOR approach, although capable of accurately representing the non-linear solution manifold of the kinetic equation, may not provide a parsimonious model of the data due to the inherently non-linear nature of the data manifold. We demonstrate how AEs are used in finding the intrinsic dimension of a system and to allow correlating the intrinsic quantities with macroscopic quantities that have a physical interpretation.


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