Far-from equilibrium molecular templating networks, like those that maintain the populations of RNA and protein molecules in the cell, are key biological motifs. These networks share the general property that assembled products are produced and degraded via complex pathways controlled by catalysts, including molecular templates. Although it has been suggested that the information propagated from templates to products sets a lower bound on the thermodynamic cost of these networks, this bound has not been explored rigorously to date. We show that, for an arbitrarily catalytic reaction network in steady state, the specificity with which a single product can dominate the ensemble is upper bounded, and the entropy of the product ensemble lower bounded, by a function of $\Delta G$, the difference between the maximal and minimal free-energy changes along pathways to assembly. These simple bounds are particularly restrictive for systems with a smaller number of possible products $M$. Remarkably, however, although $\Delta G$ constrains the information propagated to the product distribution, the systems that saturate the bound operate in a pseudo-equilibrium fashion, and there is no minimal entropy production rate for maintaining this non-equilibrium distribution. Moreover, for large systems, a vanishingly small subset of the possible products can dominate the product ensemble even for small values of $\Delta G/\ln M$.


翻译:暂无翻译

0
下载
关闭预览

相关内容

《计算机信息》杂志发表高质量的论文,扩大了运筹学和计算的范围,寻求有关理论、方法、实验、系统和应用方面的原创研究论文、新颖的调查和教程论文,以及描述新的和有用的软件工具的论文。官网链接:https://pubsonline.informs.org/journal/ijoc
【ACL2020】多模态信息抽取,365页ppt
专知会员服务
139+阅读 · 2020年7月6日
专知会员服务
53+阅读 · 2020年3月16日
FlowQA: Grasping Flow in History for Conversational Machine Comprehension
专知会员服务
23+阅读 · 2019年10月18日
Keras François Chollet 《Deep Learning with Python 》, 386页pdf
专知会员服务
144+阅读 · 2019年10月12日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
39+阅读 · 2019年10月9日
灾难性遗忘问题新视角:迁移-干扰平衡
CreateAMind
17+阅读 · 2019年7月6日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
17+阅读 · 2019年1月7日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
互信息论文笔记
CreateAMind
23+阅读 · 2018年8月23日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
Layer Normalization原理及其TensorFlow实现
深度学习每日摘要
32+阅读 · 2017年6月17日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
VIP会员
相关VIP内容
相关资讯
灾难性遗忘问题新视角:迁移-干扰平衡
CreateAMind
17+阅读 · 2019年7月6日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
17+阅读 · 2019年1月7日
disentangled-representation-papers
CreateAMind
26+阅读 · 2018年9月12日
互信息论文笔记
CreateAMind
23+阅读 · 2018年8月23日
IJCAI | Cascade Dynamics Modeling with Attention-based RNN
KingsGarden
13+阅读 · 2017年7月16日
Layer Normalization原理及其TensorFlow实现
深度学习每日摘要
32+阅读 · 2017年6月17日
相关基金
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员