斑马鱼全基因组DNA甲基化发育图谱研究

项目名称： 斑马鱼全基因组DNA甲基化发育图谱研究

项目编号： No.31171242

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 生物科学

项目作者： 罗静初

作者单位： 北京大学

项目金额： 70万元

中文摘要： 本项目拟通过高通量测序与生物信息技术，建立斑马鱼基因组DNA甲基化修饰编程与重编程检测与分析平台，获得斑马鱼全基因组DNA甲基化发育图谱；进而完成斑马鱼基因组DNA甲基化与发育相关基因表达图谱的比较分析，寻找和鉴定参与斑马鱼表观遗传调控的核心基因；参照已有文献报道数据及本项目合作者所在实验室同时进行的核移植发育重编程研究成果和进展，分析和揭示影响这一重要生物学过程的关键基因和可能机制，为器官再生、干细胞定向分化，及相关疾病的研究提供全基因组层面的实验设计策略和方案；通过和小鼠、人等其它物种基因组DNA甲基化发育图谱的比较，深化对表观遗传学现象的认识。

中文关键词： 斑马鱼；DNA甲基化修饰图谱；核移植；重编程；全基因组亚硫酸氢盐测序

英文摘要：

英文关键词： zebrafish；DNA Methylation profiling；Nuclear transfer；Reprogramming；Whole-genome bisulfite sequencing