G蛋白偶联受体识别及功能预测的分层分类模型研究

项目名称： G蛋白偶联受体识别及功能预测的分层分类模型研究

项目编号： No.30901243

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 高青斌

作者单位： 中国人民解放军第二军医大学

项目金额： 18万元

中文摘要： 现在药物研发中60～70%的目标蛋白是G蛋白偶联受体（GPCRs）,但关于它们的结构和功能却了解得相对较少。如何科学有效地利用现有数据资料，快速、高效、准确地筛选出疾病相关GPCRs，成为目前急需解决的问题。本研究在前期工作基础上，以蛋白序列数据为研究对象，探讨GPCRs功能预测的高通量分层分类模型。运用信息融合理论，对来自不同信息源的信息，构造不同的特征集，通过特征层和决策层的信息融合，建立有效的蛋白序列编码方法；在此基础上，利用决策树算法构建GPCRs分层分类模型，探讨模型性能评价指标，建立分层分类模型的科学评价方法；最后，运用智能优化算法对模型参数进行优化，建立最优分层分类模型。并依据模型开发相应的web应用软件，将其应用于人类等模式生物基因组的数据挖掘研究，检验其效能，为GPCRs功能和药物设计研究提供支持。本课题对于细胞生物学研究、疾病预防和治疗及新药开发等具有重要研究价值。

中文关键词： G 蛋白偶联受体；多源信息融合；分层分类；蛋白质组学；

英文摘要：

英文关键词： G-protein-coupled receptors；multiple information fusion；hierarchical classification；proteomics；