基于虚拟突变与结合自由能计算的抗体亲和力体外成熟

项目名称： 基于虚拟突变与结合自由能计算的抗体亲和力体外成熟

项目编号： No.31400795

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 袁晓辉

作者单位： 暨南大学

项目金额： 24万元

中文摘要： 抗体的亲和力是影响抗体能否作为药物应用的重要因素。传统的进行抗体亲和力成熟的实验方法操作繁琐、实验周期长、存在很多不确定性因素。本项目在前期工作的基础上，对课题组己经分离出来的多株低亲和力单克隆抗体利用计算结构生物学中一系列分子模拟技术建立可靠的抗原抗体分子对接模型，从抗原与抗体相互作用的形状匹配、氢键网络、疏水效应、电荷分布、阴/阳离子π键作用等因素出发，以使抗原-抗体结合自由能降低为突变导向，利用虚拟突变与分子动力学模拟在计算机水平上实现抗体亲和力体外成熟的分子设计。最后结合相关的生物学实验尤其是抗体亲和力的直接测定，对分子模拟计算与抗体分子设计的结果进行验证。本项目将分子模拟技术与生物学实验结合在一起，期望建立一种快速有效的计算机辅助抗体亲和力体外成熟的新方法，以减少抗体研发实验周期提高抗体研发效率，具有理论研究意义与实际应用价值。

中文关键词： 分子动力学模拟；分子对接；同源建模；抗体亲和力；虚拟突变

英文摘要： The affinity of monoclonal antibody is an important factor for application of mAbs as therapeutic drug clinically, lots of methods have been used conventionally for antibody affinity maturation in vitro, such as antibody library technology experiments, th

英文关键词： Molecular Dynamics Simulation；Molecular Docking；Homology Modelling；Antibody Affinity；Virtual Mutation