作物株型发育与籽粒形成之间遗传互作调控网络解析新算法及其应用研究

项目名称： 作物株型发育与籽粒形成之间遗传互作调控网络解析新算法及其应用研究

项目编号： No.91435111

项目类型： 重大研究计划

立项/批准年度： 2014

项目学科： 农业科学

项目作者： 樊龙江

作者单位： 浙江大学

项目金额： 100万元

中文摘要： 研究株型发育和籽粒形成之间基因互作调控网络，对进一步揭示作物产量复杂遗传机制及高产作物分子育种具有重要意义。本项目（1）拟开发解析株型发育和籽粒形成遗传互作网络新算法，该算法可以基于基因组、转录组和蛋白组数据进行全基因组关联分析（QTS、QTT和QTP），估算基因间上位性及基因与环境互作效应；构建生物信息学分析整合平台BioPubInfo，进一步开发阐明miRNA调控互作网络miRNetwork；（2）利用已有水稻组学数据和知识，并进一步测定两优培九永久F2群体籽粒形成关键时期转录组（包括小RNA）和蛋白质组数据，利用上述新算法及生物信息学平台，给出水稻株型发育和籽粒形成的各自遗传调控网络以及株型发育影响籽粒形成的互作调控网络。同时以玉米NAM群体基因组数据为基础进行并行分析，比较水稻和玉米株型发育与籽粒形成遗传互作调控网络及其保守性。本研究最终给出水稻株型发育和籽粒形成遗传互作调控模型。

中文关键词： 水稻；调控网络；算法；mRNA-miRNA-circRNA网络；产量

英文摘要： For further understanding of complex genetic mechanisms of crop yield and high-yield crop breeding, it is important to investigate interaction networks between genes involved in plant architecture development and grain formation. In this study, we are goi

英文关键词： Oryza sativa；regulation network；algorithm；mRNA-miRNA-circRNA network；yield