基于高通量测序数据发掘植物长非编码RNA及其调控网络研究

项目名称： 基于高通量测序数据发掘植物长非编码RNA及其调控网络研究

项目编号： No.31371328

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 陈铭

作者单位： 浙江大学

项目金额： 80万元

中文摘要： 近年来大规模的cDNA文库、tilling芯片和转录组测序的研究表明真核生物基因组绝大部分区域都是有转录活性的，不仅仅存在于蛋白编码区域。目前认为长非编码RNA（lncRNA）是长度大于200bp，而且不编码蛋白质的RNA。已知许多lncRNA参与诸多的生命活动过程，这使得人们开始关注长非编码RNA的功能和作用机制。lncRNA已成为一个热点研究领域，近几年的研究成果与文献数量不断增加。但目前为止人们对于植物中lncRNA的知识却所知甚少。本项目拟利用新一代测序的数据，结合已测序的基因组信息，系统地发掘植物拟南芥中的lncRNA。通过生物信息方法，构建lncRNA和其他生物分子，如染色质修饰蛋白、mRNA、miRNA等的RNA互作调控网络，从而对RNA的调控基因表达机制有更深入的了解。

中文关键词： 生物信息学；长非编码RNA；高通量测序数据；调控网络；植物

英文摘要： Recently Sanger sequencing of cDNA libraries, tilling array and RNA-seq have demonstrated that transcription is not limited to protein-coding regions but is pervasive instead. A growing body of literature has demonstrated that long noncoding RNA (lncRNA)

英文关键词： Bioinformatics；Long non-coding RNA；HTP sequencing data；Regulatory network；Plant