用dsDNA微阵列筛选NF-κDNA靶点及靶基因

项目名称： 用dsDNA微阵列筛选NF-κDNA靶点及靶基因

项目编号： No.60871014

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2009

项目学科： 生物科学

项目作者： 王进科

作者单位： 东南大学

项目金额： 35万元

中文摘要： 本研究运用我们发展的发卡引物在片延伸技术制备含有连续碱基突变的双链DNA 微阵列芯片[MS-dsDNA microarray],考察转录因子NF-κ#19982;众多突变DNA位点的相互作用，筛选出对NF-κ具有较高亲合性的DNA 位点；再通过对人全基因组序列的扫描，确定这些位点在基因组中的分布图谱（profile）,预测其为基因组中NF-κ的假定结合位点（putative binding sites，PBS）；并将这些PBS上下文中分布的基因预测为NF-κ#30340;假定靶基因（target genes）；最后通过文献检索和实验验证，鉴定新的NF-κ功能性（functional）结合靶点和靶基因，构建NF-κ控制的基因转录调控网络（transcriptional regulatory network），描绘NF-κ的完整生物学全貌，为NF-κ#30340;生物医学应用提供科学依据。

中文关键词： NF-κ#65292;MS-dsDNA microarray;binding sites; target genes; transcriptional regulatory network

英文摘要：

英文关键词：