代谢组学中时间序列算法及应用研究

项目名称： 代谢组学中时间序列算法及应用研究

项目编号： No.21375011

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 数理科学和化学

项目作者： 林晓惠

作者单位： 大连理工大学

项目金额： 80万元

中文摘要： 在代谢组学中，从代谢时间序列数据中提取与问题相关的关键代谢成分，分析其代谢轨迹，研究其在生理过程中的网络变化关系，对疾病致病机理、药物毒性和疗效研究具有重要意义，是生物信息学的一个重要研究课题。本项目拟根据代谢数据的个体差异及共性，研制一种基于变量的代谢轨迹的融合聚类算法和一种新的在聚类基础上对变量组评价的特征选择算法，以克服现有特征选择技术对参数和样本的敏感性，确定不同时间点具有显著差异的代谢物，分析代谢水平变化趋势。研制一种稳健的代谢网络构建算法，通过动态跟踪网络拓扑特性的变化，确定代谢过程中的关键代谢成分和关键时间点，确定发生改变的关键途径，给出样本总体代谢轨迹的变化趋势，并将算法用于肝癌发生相关的人群样本时间序列代谢组学数据中，提取与肝癌发生发展相关的生物标志物。本项目的研究也为其它疾病的诊断、致病机理与药物疗效研究提供必需的信息处理新方法。

中文关键词： 代谢组学；时间序列；代谢网络；；

英文摘要： In metabolomics, selecting the differential metabolites from the time series metabolomic data and analyzing their dynamic trajectory have become a key task in bioinformatics, which is crucial in disease diagnosis, drug research/development, etc. In this p

英文关键词： metabolomics；time series；metabolic networks；；