玉米长链非编码RNA-ZmUHR的功能及调控机理分析

项目名称： 玉米长链非编码RNA-ZmUHR的功能及调控机理分析

项目编号： No.31200914

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 遗传学与生物信息学、细胞生物学

项目作者： 邢国芳

作者单位： 山西农业大学

项目金额： 25万元

中文摘要： 长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是一类广泛存在于多种生物体中，缺乏完整的开放阅读框，不编码蛋白质，直接在RNA水平上行使功能的长度超过200nt的RNA分子，在植物的生长发育以及对逆境的适应过程中起着重要的调控作用,但对其调控机理目前却知之甚少。我们前期克隆了一个玉米特异的lncRNA基因-ZmUHR,其在玉米苗期根系和未成熟的雌穗中差异表达。本项目拟以ZmUHR为对象，通过过表达和RNAi干扰的转基因手段对其在玉米发育过程中的功能进行分析，结合转录组表达谱分析转基因材料与对照苗期根系和未成熟雌穗中的差异表达基因，构建差异表达基因的代谢网络。以期阐明该lncRNA基因对玉米生长发育的调控作用，为玉米lncRNA的功能研究提供数据和资料，并为玉米新品种选育提供材料。

中文关键词： 长链非编码RNA；幼穗发育；功能分析；玉米；

英文摘要： A large part of higher eukaryotic genomes is transcribed into RNAs lacking any significant open reading frame and beyond 200nt. This"non-coding part"has been shown to actively contribute to regulating gene expression, but the mechanisms are largely unknown.A novel long non-coding RNA(lncRNA)-ZmUHR has been cloned by us in previous study, and expressed differentially in maize seedling roots and unmature ears between the hybrid and its parental inbreds. Here, we attempt to analysis of the function and regulation mechanism of ZmUHR by overexpression and RNAi transgenetic in maize. Combined with high-throughput sequencing and digital gene expression profile analysis, contrast the differentially expressed genes between the genetically modified materials and inbred line Zong3 in seedling roots and unmature ears. Constructing the metabolic network of differentially expressed genes, to clarify the function of long non-coding RNA for corn growth and development, to provide data and materials for the study of long non-coding RNA, and provide materials for maize breeding.

英文关键词： Long non-coding RNA；Young panicke development；Function analysis；Maize；