项目名称: 甲状腺癌发生相关RNA编辑变化鉴定及功能研究

项目编号: No.31401110

项目类型: 青年科学基金项目

立项/批准年度: 2014

项目学科: 生物科学

项目作者: 李中山

作者单位: 温州医科大学

项目金额: 24万元

中文摘要: 甲状腺癌是人类最常见的内分泌系统恶性肿瘤,其发病率逐年上升,甲状腺发生的分子机制目前了解的不是很清楚。RNA编辑是一种真核生物中广泛存在的转录后修饰现象,在人类转录组中上千个基因的上万个位点都有发现,可能通过改变蛋白质编码,pre-mRNA剪切,miRNA结合以及RNA降解等多种方式调控基因表达。研究发现RNA编辑可能和多种人类疾病包括癌症发生相关。为了研究RNA编辑编辑和甲状腺癌发生的关系,探寻到潜在的可能用于疾病诊断以及药物治疗的编辑位点, 我们利用高通量转录组测序技术检测14对甲状腺癌和其癌旁样本的RNA编辑情况,并依据现有方法开发出准确可信的分析流程,帮助我们总体了解RNA编辑在甲状腺癌中的变化趋势,鉴定出甲状腺癌相关变化位点,再结合公共数据库基因组注释信息筛选出潜在功能RNA编辑位点,以为甲状腺癌的诊断治疗提供科学依据。

中文关键词: RNA编辑;转录组测序;变异;注释;敲减

英文摘要: throid cancer is one of the most common Secretory System tumor and its incidences increase dramatically during recent years, and the underlying molecular mechanisms is still unclear and so no effective clinical treatment for the moment. RNA editing is one

英文关键词: RNA editing;transcriptome sequencing;mutation;annotation;knock down

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