基于质谱数据的非限制性翻译后修饰检测算法研究

项目名称： 基于质谱数据的非限制性翻译后修饰检测算法研究

项目编号： No.30900262

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 付岩

作者单位： 中国科学院数学与系统科学研究院

项目金额： 20万元

中文摘要： 蛋白质翻译后修饰（PTM）能够改变蛋白质的结构，调控蛋白质的活性。研究 PTM 对于阐明蛋白质的功能，解释疾病的发生机理等，都具有十分重要的意义。基于质谱技术的蛋白质组学为大规模PTM研究提供了有效的分析手段，利用串联质谱数据检测PTM已成为目前蛋白质组学研究的核心和前沿问题之一。但是，常规的质谱数据分析算法和蛋白质鉴定软件采用限制性的PTM检测模式，具有盲目性、搜索空间组合爆炸、不能发现新类型PTM等严重问题。本课题旨在提出一个完整高效实用的非限制性PTM检测计算解决方案。所谓非限制性,是指无需人为预限定一个PTM列表，而能够检测任意PTM。本课题拟采取分而治之、逐步深入的数据分析策略，针对不同特点的PTM，使用不同的PTM检测算法，包括：高丰度PTM快速发现、开放式谱-谱匹配、开放式肽-谱匹配等。通过深入挖掘质谱数据中蕴藏的丰富PTM信息，为生物知识的发现提供有效的计算分析手段。

中文关键词： 蛋白质组学；生物信息学；翻译后修饰；质谱；非限制

英文摘要：

英文关键词： Proteomics；Bioinformatics；Posttranslational modification；Mass spectrometry；Unrestricted