长链非编码RNA与RNA结合蛋白的互作调控网络和功能研究

项目名称： 长链非编码RNA与RNA结合蛋白的互作调控网络和功能研究

项目编号： No.91440110

项目类型： 重大研究计划

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 杨建华

作者单位： 中山大学

项目金额： 100万元

中文摘要： 长链非编码RNA（lncRNA）与RNA结合蛋白（RBP）结合，参与多种生物学过程的调控，并在肿瘤的发生发展中发挥重要作用。然而，绝大多数lncRNA的作用机制及其与RBP之间互作的规律仍有待阐明。我们前期研究开发了starBase 和ChIPBase两大功能分析平台(ESI高引用论文)实现对非编码RNA功能靶标组、互作组和lncRNA转录调控网络的研究。在此基础上，本项目拟通过大规模整合CLIP-Seq数据，开发基于概率罚分等模型并结合功能基因组数据的新算法及平台，系统地鉴定lncRNA与RBP的互作调控网络，并对新的lncRNA的功能进行准确预测。该算法和平台可有效地用于鉴定肿瘤特异的lncRNA与RBP的互作网络，探讨它们在肿瘤发生发展过程中的作用，从而扩展我们对lncRNA及其互作调控网络在生理与疾病中作用的认识。

中文关键词： 长链非编码RNA；RNA结合蛋白；CLIP测序技术；肿瘤发生发展；调控网络

英文摘要： Long non-coding RNAs (lncRNAs) play important roles in a variety of biological processes that have been implicated in regulating tumorigenesis through interaction with RNA-binding proteins (RBPs). However, for the majority of lncRNAs, the mechanism underl

英文关键词： lncRNA；RNA-binding protein；CLIP-seq；tumorigenesis；regulatory networks