项目名称: 响应地黄连作的关键lncRNAs鉴定及作用研究
项目编号: No.81403037
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 医药、卫生
项目作者: 杨艳会
作者单位: 河南工业大学
项目金额: 23万元
中文摘要: 连作障碍严重制约着中药材的生产。申请者前期研究发现连作地黄体内有lncRNAs差异表达。为确证lncRNAs在连作中的作用,本项目拟以地黄品种“温85-5”为供试材料,头茬为对照、连作为处理,在块根膨大前期,分别提取根、叶总RNA,利用Solexa测序、生物信息学、qPCR和Race等技术,主要研究:①分别构建“只含”与“不含”polyA的转录本库,候选lncRNAs。②构建sRNAs库,根据与候选lncRNAs匹配特征,鉴定lncRNAs;构建降解组库,寻找lncRNAs序列中降解片段,鉴定剪切的靶基因;根据靶基因功能,筛选逆境胁迫的lncRNAs。③测定lncRNAs时空表达模式,分析其与连作症状是否吻合,确定响应连作的关键lncRNAs。④克隆lncRNAs全长,验证在连作中的特异表达,最终锁定关键的lncRNAs,解读lncRNAs在连作毒害中的作用,为克服连作障碍难题奠定基础。
中文关键词: 地黄;连作障碍;长链非编码RNA;逆境胁迫;作用
英文摘要: Continuous monoculture problem seriously affects the production of traditional Chinese medicinal materials. According to the applicant previous researches, differential expressed lncRNAs were found in continuous monoculture Rehmannia glutinosa. To confirm
英文关键词: Rehmannia glutinosa;continuous monoculture problem;lncRNA;adversity stress;function