项目名称: SNP致STR毛细管电泳异常迁移机制探索及法医学研究
项目编号: No.81401562
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 医药、卫生
项目作者: 陈鹏宇
作者单位: 遵义医学院
项目金额: 23万元
中文摘要: STR自动分型是当前法医DNA分析的主流技术,其对STR片段长度分型的准确性是应用于法医物证鉴定的前提。STR自动分型是一种片段长度多态性分析技术,目前普遍认为,其分型结果只与STR序列长度有关,不受序列内部碱基变异的影响,毛细管电泳检测到与Ladder有长度差异的未知片段都来源于长度多态性变异机制。然而,最近我们发现,STR侧翼区的SNP可以引起STR毛细管电泳时约1bp的异常迁移和按照长度多态性原则的错误分型,是一种导致OL等位基因形成的新机制,对STR的分型理论和法医学应用提出了新的挑战。本研究在我们对其机制初步研究的基础上,拟通过筛选和构建不同STR侧翼区潜在二级结构的SNP变异模型,采用梯度的电泳条件,系统分析不同变异模型分子特征和电泳平台检测条件这两种内外影响因素与异常迁移行为的关系,深化法医对STR分型的认识,以期制定出相应的风险应对策略,为STR的法医学应用提供指导。
中文关键词: 短串联重复序列;异常迁移;单核苷酸多态性;毛细管电泳;二级结构
英文摘要: Automatic STR typing is the mainstream technology of current forensic DNA analysis,the accuracy of STR sequence length detection is a prerequisite for application in forensic identification cases. STR profiling belongs to fragment length polymorphism anal
英文关键词: short tandem repeat;abnormal migration;single nuecleotide polymorphism;capillary electrophoresis;secondary structure