胁迫诱导苹果内源逆转座子atr1活性表达的甲基化调控机制及其转座标签研究

项目名称： 胁迫诱导苹果内源逆转座子atr1活性表达的甲基化调控机制及其转座标签研究

项目编号： No.31372043

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 农业科学

项目作者： 孙俊

作者单位： 安徽农业大学

项目金额： 80万元

中文摘要： 为促进苹果功能基因组学研究，开展基于逆转座子的芽变育种工作，揭示具有转座活性的苹果内源逆转座子atr1活性表达调控机理，创建突变体并建立atr1转座标签，拟以获得atr1的"元帅"为试材，借助已证实的atr1转录激活胁迫条件，分别利用BSP、Southern杂交和qRT-PCR检测胁迫处理过程中atr1甲基化位点、水平、模式与状态的变化、转座插入位点的变化以及表达活性的变化，分析不同胁迫作用的甲基化位点与胁迫过程中atr1甲基化变化规律；解析atr1甲基化与表达活性相关性，阐明胁迫激活atr1的甲基化调控机制；获得调控atr1转座插入频率的胁迫条件及atr1转座插入突变体；建立atr1转座标签体系分离突变体中转座插入位点侧翼序列，分离突变基因；结合突变体田间表现分析变异性状，预测突变基因功能。本研究将为利用逆转座子atr1构建苹果突变体库，培育芽变品种及开展苹果功能基因组学研究奠定基础。

中文关键词： 苹果；短枝突变；长末端重复序列逆转座子；solo LTR；双向启动子活性

英文摘要： For promoting the development of apple functional genomics and bud mutation breeding, the present study is designed to reveal the the role of cytosine methylation of atr1 (an isolated transposable endogenous retrotransposon in apple genome) DNA on transpo

英文关键词： Malus × domestica；Spur mutation；Long terminal repeat retrotransposons；solo LTR；Bidirectional transcription