生物信息学中的序列分析相关问题研究

项目名称： 生物信息学中的序列分析相关问题研究

项目编号： No.61379108

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 潘毅

作者单位： 中南大学

项目金额： 75万元

中文摘要： 测序技术的发展和随之产生的海量序列数据对现代生命科学研究带来了前所未有的机遇和挑战。如何采用计算机技术解决序列分析的前沿问题成为国家重大战略需求和重大工程需求的关键任务。本项目分别研究新一代测序技术下的片段比对算法、短片段组装算法、多序列比对算法与SNP序列与疾病关联性分析算法。通过收集序列数据和其他相关生物数据，并对其数据本身进行特症挖掘，基于多序列比对的结果，在云计算平台下参考比对短片段，然后组装这些短片段，进行SNP与疾病关联分析，最后再使用实际生物数据以及反馈信息对相关算法进行验证与改进。本项目的研究将为海量序列数据的分析提供高效的计算方法，为疾病诊断与治疗的研究提供新思路。

中文关键词： 比对；组装；序列分析；生物信息学；

英文摘要： The development of sequencing technology and massive sequence data has provided unprecedented opportunities and challenges to the research of bioinformatics. How to exploit computer technology to solve the current problems of sequence analysis has become

英文关键词： mapping；assembly；sequence analysis；bioinformatics；