项目名称: 拟南芥中构成植物表观基因组的非编码RNA的转录与加工机制
项目编号: No.91440105
项目类型: 重大研究计划
立项/批准年度: 2014
项目学科: 生物科学
项目作者: 陈雪梅
作者单位: 深圳大学
项目金额: 100万元
中文摘要: 植物、动物和真菌的转录组研究发现转录组中含有大量非编码RNA,但其功能尚不清楚。本项目申请人实验室在拟南芥中鉴定了RNA聚合酶Pol IV的转录物,Pol IV和 Pol V的转录物或作为siRNA的前体或作为支架募集siRNA到其同源染色质区域,共同参与RNA指导的DNA甲基化(RdDM)。RdDM能沉默转座子和重复序列以及调控蛋白质基因的表达。迄今为止,非编码RNA的转录、加工和降解机制几乎一无所知,非编码RNA如何被核内RNA加工复合体识别,并被区别于蛋白质编码RNA对待,也尚不清楚。本项目旨在系统分析Pol IV和 Pol V转录产物的序列特征;研究非编码RNA的生物合成和加工机制。研究结果将有助于阐明表观基因组的构成,也有助于我们了解不仅植物中,而且动物中基因组稳定性的调控,因为动物中的piRNAs和植物中的siRNAs在调控基因组稳定性方面有着相似的功能。
中文关键词: RNA指导的DNA甲基化;Pol IV;长链非编码RNA;生物合成和降解;DNA甲基化
英文摘要: Transcriptome studies in plants, animals, and fungi have revealed pervasive transcription in genomes and the presence of multitudes of noncoding transcripts, although the functions of the noncoding transcripts are largely unknown. Recent studies in Arabid
英文关键词: RNA-directed DNA methylation;Pol IV;long noncoding RNAs;biogenesis and degradation;DNA methylation