我国宋内志贺菌的流行变迁及变异进化规律研究

项目名称： 我国宋内志贺菌的流行变迁及变异进化规律研究

项目编号： No.81373053

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 医药、卫生

项目作者： 邱少富

作者单位： 中国人民解放军军事医学科学院

项目金额： 70万元

中文摘要： 近年来，在我国由志贺菌引起的细菌性痢疾的病死率在所有传染病中位居前四，而且宋内志贺菌正逐渐取代福氏志贺菌成为其主要病原。此外，本课题组首次发现ONPG阴性宋内志贺菌在我国的流行，其在部分地区已超过ONPG阳性菌成为优势菌型。宋内志贺菌这种新的流行变异趋势及其对公共健康的威胁不容忽视。本研究将在前期工作基础上，开展我国宋内志贺菌特别是ONPG阴性菌的流行变迁与变异规律研究；通过代表性菌株的全基因组测序及深入的生物信息学分析，揭示ONPG阴性菌流行的分子机制，阐明基因重组、插入/缺失、水平转移等遗传事件在宋内志贺菌毒力和耐药变化及其在进化中的作用；通过系统发生分析与种群结构重建，探究我国宋内志贺菌包括ONPG阴性菌在时空上的传播演化规律，以及与国外宋内志贺菌的传播进化关系，从而为细菌性痢疾的检测监测、暴发疫情的早期预警与识别、传染源的追溯、传播关系的调查以及防控策略的制订提供科学依据。

中文关键词： 宋内志贺菌；ONPG表型；多重耐药性；全基因组测序；微进化

英文摘要： The surveillance data from the Chinese National Infectious Disease Internet Reporting System showed that the reported annual incidence of shigellosis in China was one of the top four notifiable infectious diseases in recent years. Among Shigella spp., Shi

英文关键词： Shigella sonnei；ONPG phenotype；multidrug resistance；Whole genome sequencing；microevolution